При Петербургской Академии наук в 1898 году, создали Комиссию для организации праздника столетия со дня рождения выдающегося поэта А. С. Пушкина. Главой комисси стал Константин Константинович, Великий Князь – президент Академии наук, в те времена популярный, как поэт К.Р. Для того, чтобы увековечить память поэта, было принято решение создать учреждение, в котором бы изучали творчество и жизнь Александра Сергеевича, а также воздвигнуть памятник.
Юбилей отмечали в 1899 году с таким размахом, что была охвачена вся Россия, а не только города или места, которые так или иначе связаны с жизнью Александра Пушкина. При этом в программу входили самые разные мероприятия. В те дни было открыто множество школ имени поэта, в честь него были переименованы улицы, организованы выставки, лекции, открыты библиотеки. Типографии выпускали сочинения поэта огромными тиражами. Но в центре внимание было одно, главное событие – государство приобрело имение Михайловское в псковской губернии, которое принадлежало роду Пушкиных.
В Петербурге в честь 100 летия со дня рождения поэта была организована выставка. Для нее довольно длительное время собирались экспонаты, и именно поэтому выставка получилась интересной. Здесь можно было увидеть самые разные издания его произведений, автографы поэта, портреты Пушкина и его современников. Именно эта выставка стала толчком для создания, так называемого, пушкинского учреждения. Члены Комиссии решили, что лучше всего будет воздвигнуть не памятник, а особый музей. В музее имени Пушкина должны были быть собраны различные сведения, касающиеся всех поэтов и писателей – художников слова. Эти события вызвала всеобщее одобрение членов Комиссии. 15 декабря 1905 годабыло принято решение о создании Пушкинского Дома. Уже через год было принято и "Положение о Пушкинском Доме". И говорилось в нем, что Пушкинский Дом является государственным достоянием и что работает над ним Императорская Академия наук.
В тот же год государство выделило средства для приобретения личной библиотеки поэта. И сейчас, все книги, которые находились в последней квартире Александра Сергеевича на Мойке, 12, расположены в одном из отделов Пушкинского дома. После этого в Пушкинский Дом приходило много подарков – картины, рукописи, скульптуры, книги. Вскоре приобрели первые автографы Пушкина. На данный момент практически все рукописи поэта находятся именно в Пушкинском Доме. В 1907 году подняли вопрос о том, что есть ли возможность приобрести парижскую коллекцию А.Ф. Отто, известного под псевдонимом "Онегин". После смерти поэта, многие его деловые бумаги и рукописи были у Жуковского. Жуковский передал их своему сыну, который находился в дружеских отношениях с Отто. Помимо этого, Отто, как коллекционер, тогда собирал рукописи, касающиеся истории русской литературы. В 1925 году эта богатейшая коллекция перешла в собственность Пушкинского Дома.
Пушкинский Дом набирал все больше и больше различных материалов, но при этом не имел собственного здания. Первоначально все коллекции хранились в Академии наук и испытали много переездов. Наконец, в 1927 году Пушкинскому Дому было предоставлено здание на набережной Макарова. Это было здание бывшей Морской Таможни, построенное в начале 19 века. Согласно одному из преданий, Пушкин был здесь. В 1930 году Пушкинский Дом стал ИРЛИ (институт русской литературы).